如果細菌能成功侵入身體,免疫系統的前線士兵便會立刻作出回應。這種稱為先天免疫功能(innate
immunity)的系統包括粒性細胞(granulocytes)、巨噬細胞(macrophages)和其白血細胞能迅速辨別微生物,將其吞噬消化或釋放毒素殺死。
抗菌過程中免疫細胞會釋放一些稱為白介素(cytokines)的有機化合物。白介素有很多不同種類,用途包括增強免疫細胞功能、招攬其他免疫細胞和引起發炎。
有一些病菌能抵抗先天免疫功能;
譬如肺結核細菌被巨噬細胞吞噬後不單只能繼續生存,還能在細胞內繁殖,將細胞當作避難所。這類情況便需要動用後防士兵。這種稱為後天免疫功能(acquired immunity)的系統包括T和B淋巴細胞。
T細胞能直接或輔佐其他細胞將病菌消除,而B細胞則負責製造抗體。淋巴細胞有特異性,每一個細胞只能辨認一種微生物。